Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sh3bp1P55194 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sh3bp1P55194 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms