Protein–RNA interactions for Protein: P55144

Tyro3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyro3P55144 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tyro3P55144 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms