Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rad23bP54728 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rad23bP54728 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms