Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApodP51910 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApodP51910 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApodP51910 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApodP51910 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApodP51910 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApodP51910 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApodP51910 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApodP51910 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms