Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpc4P51655 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpc4P51655 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms