Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Defa8P50706 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Defa8P50706 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms