Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TubP50586 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TubP50586 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TubP50586 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TubP50586 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TubP50586 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TubP50586 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TubP50586 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TubP50586 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TubP50586 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TubP50586 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TubP50586 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TubP50586 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TubP50586 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms