Protein–RNA interactions for Protein: P49660

Sstr4, Somatostatin receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr4P49660 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sstr4P49660 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms