Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gbx2P48031 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms