Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pax7P47239 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms