Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TesP47226 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TesP47226 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TesP47226 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TesP47226 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TesP47226 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TesP47226 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TesP47226 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TesP47226 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TesP47226 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TesP47226 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TesP47226 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TesP47226 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms