Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vps26aP40336 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms