Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ptpn11P35235 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ptpn11P35235 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms