Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RxrgP28705 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxrgP28705 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RxrgP28705 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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