Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjb3P28231 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms