Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BrafP28028 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BrafP28028 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BrafP28028 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BrafP28028 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BrafP28028 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BrafP28028 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms