Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gria1P23818 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gria1P23818 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms