Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxd12P23812 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxd12P23812 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms