Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja1P23242 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja1P23242 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms