Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PparaP23204 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PparaP23204 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PparaP23204 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PparaP23204 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms