Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tap1P21958 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tap1P21958 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms