Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pou5f1P20263 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms