Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P20040 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P20040 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P20040 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P20040 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P20040 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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