Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnnc1P19123 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnnc1P19123 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms