Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P18533 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P18533 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P18533 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P18533 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18533 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18533 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18533 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18533 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P18533 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P18533 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms