Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P18524 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P18524 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P18524 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P18524 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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