Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Defa-rs1P17533 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Defa-rs1P17533 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms