Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fv4P11370 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fv4P11370 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fv4P11370 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fv4P11370 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms