Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
PolP10400 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PolP10400 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
PolP10400 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
PolP10400 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
PolP10400 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
PolP10400 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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