Protein–RNA interactions for Protein: P09926

Surf2, Surfeit locus protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf2P09926 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Surf2P09926 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms