Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApoeP08226 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ApoeP08226 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms