Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Egr1P08046 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Egr1P08046 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Egr1P08046 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Egr1P08046 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Egr1P08046 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Egr1P08046 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Egr1P08046 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms