Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Spta1P08032 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Spta1P08032 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms