Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gnpda1O88958 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gnpda1O88958 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms