Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdkO55028 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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