Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LatO54957 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LatO54957 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LatO54957 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LatO54957 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LatO54957 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms