Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pole2O54956 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms