Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sema6bO54951 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms