Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2f6O54917 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms