Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sdc4O35988 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Sdc4O35988 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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