Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Bnc1O35914 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Bnc1O35914 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms