Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms