Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Prrt1O35449 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Prrt1O35449 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Prrt1O35449 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Prrt1O35449 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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