Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KeraO35367 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KeraO35367 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KeraO35367 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KeraO35367 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KeraO35367 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KeraO35367 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KeraO35367 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms