Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kpna4O35343 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna4O35343 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms