Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RrhO35214 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RrhO35214 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RrhO35214 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RrhO35214 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RrhO35214 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RrhO35214 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RrhO35214 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RrhO35214 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RrhO35214 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RrhO35214 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RrhO35214 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RrhO35214 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RrhO35214 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RrhO35214 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RrhO35214 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RrhO35214 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RrhO35214 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RrhO35214 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RrhO35214 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RrhO35214 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RrhO35214 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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