Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nedd9O35177 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms