Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-Q1O19441 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms