Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ncoa3O09000 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ncoa3O09000 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ncoa3O09000 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms