Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5814J3QP80 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms